Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms