Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms