Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms