Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms