Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms