Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms