Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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