Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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