Protein–RNA interactions for Protein: Q96RU2

USP28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP28Q96RU2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP28Q96RU2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP28Q96RU2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP28Q96RU2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP28Q96RU2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP28Q96RU2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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USP28Q96RU2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP28Q96RU2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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