Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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GTF3C6Q969F1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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GTF3C6Q969F1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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GTF3C6Q969F1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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