Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms