Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms