Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms