Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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