Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LRRC17Q8N6Y2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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