Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms