Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms