Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms