Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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