Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SFT2D3Q587I9 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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