Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms