Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTLL9Q3SXZ7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms