Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms