Protein–RNA interactions for Protein: Q17R89

ARHGAP44, Rho GTPase-activating protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP44Q17R89 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP44Q17R89 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP44Q17R89 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms