Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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