Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms