Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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