Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms