Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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