Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
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