Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
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