Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNB1Q14721 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNB1Q14721 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms