Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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