Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTCH1Q13635 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTCH1Q13635 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTCH1Q13635 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTCH1Q13635 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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