Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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