Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLN3Q13286 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLN3Q13286 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLN3Q13286 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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