Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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