Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms