Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FOXO1Q12778 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FOXO1Q12778 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FOXO1Q12778 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FOXO1Q12778 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FOXO1Q12778 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FOXO1Q12778 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FOXO1Q12778 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FOXO1Q12778 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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