Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms