Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms