Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms