Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms