Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms