Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63132 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms