Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms