Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.2 ms