Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TPTEP56180 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms