Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms