Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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ACTR1BP42025 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ACTR1BP42025 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ACTR1BP42025 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTR1BP42025 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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